Onder de bondgenoten van Athena bevonden zich veel helden uit de Griekse mythologie, waaronder Odysseus Jason Perseus en Heracles. Omdat ze de kant van de Grieken koos in de Trojaanse oorlog, waren onder meer Parijs en de andere verdedigers van Troje haar vijanden. Tot haar tegenstanders behoorden Hephaestus en Poseidon.
Volgens de Griekse mythologie hielp Athena Jason bij het verkrijgen van het Gulden Vlies. Ze hielp Perseus ook bij het onthoofden van Medusa. Ze adviseerde Heracles om de eigen klauwen van de Nemeïsche leeuw te gebruiken om door zijn onneembare huid te snijden, gaf hem een rammelaar om de Stymphaliaanse vogels bang te maken, zodat hij ze kon doden en hielp hem de onderwereld binnen te gaan om Cerberus te verslaan. Athena bood Odysseus raad gedurende de hele Trojaanse oorlog, beschermde hem tijdens zijn omzwervingen, leidde hem naar huis en hielp hem bij het herwinnen van zijn huis en zijn vrouw.
Een Griekse mythe vertelt dat Aphrodite Hera en Athene allemaal beweerden de mooiste godin te zijn en dat Zeus Paris tot Trojaanse prins benoemde om tussen hen te beslissen. Parijs verkoos Aphrodite boven Athene en dit zorgde ervoor dat Athena de Griekse kant verkoos in de Trojaanse oorlog. Hoewel zowel Ares als Athena vertegenwoordigers van de oorlog waren, symboliseerde ze wijsheid, inzicht, moed, glorie en morele superioriteit in plaats van angst en bloeddorst. Hoewel wordt erkend dat Athena een maagdelijke godin is, werd ze moeder. Hephaestus, de zoon van Zeus en Hera, probeerde haar te verkrachten en toen zijn zaad van haar been op de aarde viel, werd de half slang half mens Erichthonius geboren. Poseidon werd de tegenstander van Athene vanwege een ruzie over wie de beschermheilige van Athene zou worden. In hun competitie boden ze elk de Atheners geschenken aan. Poseidon bood de Atheners een zoutwaterfontein aan, maar Athene won door hen een olijfboom aan te bieden.
