John Hagee schreef in 1975 in een brief aan zijn gemeente dat hij zich schuldig had gemaakt aan immoraliteit, waarna hij scheidde van zijn vrouw Martha Downing. De exacte immoraliteit is onbekend. Hij trouwde op 12 april 1976 met Diana Castro, een lid van zijn gemeente. Het hertrouwen onmiddellijk na zijn scheiding leidde tot beschuldigingen dat hij tijdens zijn huwelijk een affaire had gehad.
grasmaaiers gemaakt in de VS
Hagee trouwde in 1960 met Downing en het echtpaar kreeg samen twee kinderen. Hagee was predikant bij de Trinity Church in San Antonio, maar kritiek op zijn scheiding zorgde ervoor dat hij ontslag nam.
Hagee heeft drie kinderen met Castro genaamd Matthew Christina en Sandy. Hagee en zijn kinderen met Castro zijn ook muzikanten die samen optraden als The Hagees.
Op 11 mei 1975 startte Hagee een nieuwe kerk genaamd The Church at Castle Hills. Hoewel het aanvankelijk slechts 25 leden had, groeide het snel in omvang, wat leidde tot twee uitbreidingen. De eerste was een heiligdom met 1600 zitplaatsen en de tweede was een heiligdom met 5000 zitplaatsen. Hagee noemde het tweede heiligdom Cornerstone Church. Zijn zoon Matthew nam later het roer over als uitvoerend predikant van de kerk.
Hagee heeft boeken geschreven en talloze religieuze televisiestations zenden zijn preken uit. Hij heeft ook religieuze organisaties opgericht.